In de loop van de 17e eeuw groeide de stad Middelburg zo snel, dat werd besloten tot de bouw van de Oostkerk. Een mooie koepelkerk. Het orgel werd in 1782 door de Vlaamse gebroeders De Rijckere opgeleverd. Het werd echter direct afgekeurd vanwege o.a. onbruikbare windladen en slecht geïntoneerde registers, zodat de klankgeving niet klopte. Pas in 1783 voltooiden de Middelburgse stadsorgelmaker Johannes van Overbeek, zijn zoon en Reichner jr. het orgel. Tussen 1970 en 1974 vond een algehele restauratie plaats door de firma Leeflang. In 1996 werden nieuwe restauraties uitgevoerd, waarbij o.a. de kas in de oorspronkelijk kleurstelling werd geschilderd. Door de sterke terugloop van kerkgangers en de hoge onderhoudskosten zag de Protestantse Gemeente Middelburg, de huidige eigenaar, zich genoodzaakt de kerk begin 2017 te sluiten. Daarmee kwam er een einde aan 350 jaar kerkdienst. De kerk wordt nu gebruikt voor orgelconcerten, lezingen, tentoonstellingen en dergelijke.