De houtpantserjuffer behoort tot een groepje van 5 metallic groene waterjuffers, toch is ze gemakkelijk te herkennen want de houtpantserjuffer is de grootste, mannetjes worden niet blauwig en de vlekjes in de vleugels zijn wit en de ogen maken meestal een bruine indruk, verschil met de andere pantserjuffers want die zijn blauwachtig.
Er kan een lengte worden bereikt van 45 tot 50mm en de spanwijdte loopt op van 50 tot soms 60mm.