Om de ruïnes te bereiken dien je naar het dorpje Sayaxché te gaan. Een privé-boot brengt je vervolgens in anderhalf uur naar het hotel, midden in de jungle aan het meer van Petexbatún brengt. Dit is een mooie boottocht, onderweg zie behlave de schitterende natuur, de diverse soorten watervogels, leguanen en krokodillen.
Vanaf het hotel is het, wederom een mooie bootocht, een ruim uur varen per boot tot de ruïnes van Aguateca, die bijna helemaal in de jungle (mooie wandeling door de jungle en kies dan de kloof om de ruïnes te bereiken) verscholen liggen. Deze ruïne wordt niet vaak bezocht omdat hij alleen bereikbaar is per boot.