De Yeni Cami moskee ligt aan de ingang van de Egyptische bazaar, niet ver van de Galatabrug over de Gouden Hoorn, die het district Eminönü met Galata verbindt.
De moskee heeft een binnenplaats aan de kant van de bazaar, waar zich wasbakken en fonteinen voor de gelovigen die komen bidden bevinden. De omgang om de binnenplaats wordt bedekt met 21 kleine koepels. De moskee zelf heeft een vierkante plattegrond. De belangrijkstre koepel rust op vier kleinere halfkoepels. De moskee wordt geflankeerd door twee minaretten met drie omgangen.